Belge kullanımı sırasında sistem kopukluğu nedeni ile yaşanan tahsis aşımlarında yani MBR aşımlarında (Madde Bilgileri Revize Aşımlarında) belge kapama sırasında müeyyide doğmaktadır. Ödenecek olan müeyyide tutarı , tahsis aşımını yaratan ithalat miktarına tekabül eden ve ithalat sırasında doğan vergiler ve faiz kadardır. Hammadde Sarfiyat aşımlarında ödenen 2 katı para cezaları MBR aşım için geçerli değildir. Bunun sebebi ise , genel olarak bu aşımların , taahhüt edilen ihracattan daha fazla ihracat yapılması ancak bunun karşılığında gerekli madde bilgileri revizesi yapılmadan ithalat yapılması buna ek olarak da sistemsel hatalardan ve kopukluklardan dolayı, tahsis miktarını doğru bilgiden kontrolünü yapamaması sonucu oluşan MBR aşımlarında aslında karşılığında yeterli ihracatın olmasıdır.
Bu aşımın Dahilde işleme izin belgesi kullanımı sırasında fark edilerek , belge süresi içerisinde serbest dolaşıma sokulmak sureti ile muafiyet kapsamından çıkartılması, müeyyideden kurtarmamaktadır. Bu durum oldukça yanlış anlaşmalara ve anlaşmazlıklara neden olduğundan Ekonomi Bakanlığı 10.03.2014 tarihinde Türkiye’de bulunan tüm İhracatçılar Birliklerine gönderdiği yazı ile 2005/8391 sayılı Bakanlar Kurulu Kararı eki Dahilde İşleme Rejimi Kararı 22.maddesine dayandırarak müeyyidenin her şekilde uygulanacağını kesinleştirmiştir.